去书店买了推理小说新刊的柯南，在那里遇到了奇怪的父子。因为孩子拿着的胶囊玩具掉了，柯南捡了起来，却发现那里有写着“救命”的笔记。紧随其后的柯南对孩子说“捡到了失物”，就这样引导他到了厕所。因为两个人很难逃跑，所以和被绑架的少年三村和雄交换衣服。顺利调换成功，柯南决定和绑架犯们一同行动。 柯南观察了移动的汽车的情况和两人的情况，知道了绑架犯是若井隼人和若井千秋夫妇。隼人联系和雄的父亲三村正海说：“你的儿子已经在我们手里了。如果想要我们把人还回去的话，请用用过的纸币准备3亿日元的现金。”电话的对方正海，从提要求的金额等推测出是三村重工的首席执行官。若井夫妇随身携带着包含指示书和必要物品的公文包，柯南认为其他人也很有可能与之相关。 另一边，三村家有正海、和雄的母亲三村奈穗、弟弟三村荣，还有目暮警部、高木刑警、千叶刑警等警察的身影。不知道和雄已经被柯南调包的家人担心他的人身安全。目暮警官等人也在全力侦查……
