Sto lat temu wskutek ruchu płyt tektonicznych spora część zamieszkałego lądu znalazła się pod wodą. W pozostałych na powierzchni miejscach zbudowano porty, rozdzielone bezkresnym oceanem, a Japonia stała się morską potęgą. To właśnie stamtąd pochodzą Błękitne Syreny - specjalnie przeszkolone kobiety zajmujące się utrzymaniem bezpieczeństwa i pomocą w kontaktach międzynarodowych na wodnych szlakach. Fabuła skupia się na perypetiach przyjaciółek z dzieciństwa, Akeno Misaki i Moeki Chiny, które bardzo chcą zostać Błękitnymi Syrenami. Dziewczęta zapisują się do specjalnej szkoły, gdzie będą musiały wykazać się odpowiednimi cechami, umożliwiającymi im rozpoczęcie wymarzonej kariery.
