I sæson 3 rystes Kingstown og beboerne af en række eksplosioner, da et nyt medlem af den russiske mafia slår sig ned i byen, og en narkokrig raser både i og udenfor fængslet. Mike McLusky (Renner) er under pres for at afslutte krigen, men tingene kompliceres, da et velkendt ansigt fra hans tid i fængslet truer med at underminere borgmesterens forsøg på at slutte fred på alle fronter.